Les champignons sont structurés en filaments appelés hyphes, qui sont constitués de chaînes de cellules et séparés les uns des autres par des cloisons ou des parois transversales. Beaucoup de ces hyphes regroupés forment le mycélium.
Les cloisons, ou parois transversales, entre chaque filament sont criblées de pores, permettant la circulation et le transport des nutriments à travers le champignon. Bien que la majorité des champignons soient constitués de filaments d'hyphes formant une structure de mycélium, les hyphes cénocytaires sont séparés par des parois nettes.
Une cellule fongique est constituée d'un noyau et d'organites. Comme les plantes, les cellules des champignons sont entourées de parois cellulaires, mais les parois cellulaires n'ont pas de chloroplastes, qui sont les unités dans lesquelles se produit la photosynthèse, car les champignons ne fabriquent pas de nourriture à partir du soleil. Les parois cellulaires sont constituées de quatre composants : la chitine, les glucanes, les protéines et la mélanine. La chitine est composée de brins de sucre liés entre eux afin de former un motif fort dans le mur. Les glucanes sont également constitués de sucre lié, mais ils ont une forme plus flexible. La mélanine aide à renforcer la paroi cellulaire et à protéger le champignon des dommages causés par le soleil. Certaines protéines retiennent l'eau dans les cellules, protégeant ainsi le champignon de la déshydratation.
