Selon la revue scientifique Nature, les différences entre les pseudohyphes et les hyphes sont dictées par la forme des cellules, l'emplacement de l'anneau de septine et du septum par rapport à la cellule mère et le déplacement du noyau de la cellule mère. Le degré de croissance polarisée et le degré auquel les cellules filles sont capables de se séparer en cellules individuelles créent également une distinction entre les pseudohyphes et les hyphes.
Les hyphes, la forme plurielle d'hyphes, sont considérées comme les éléments constitutifs de la plupart des champignons. Par exemple, ils forment le corps d'un champignon. Ils sont composés de parois tubulaires filamenteuses ressemblant à de minuscules fils qui sont divisés en cellules individuelles par des septa ou septum, les parois transversales de la cellule. Les cellules hyphales individuelles sont longues, fines et hautement polarisées, sans chevauchement ni constriction évidents entre les cellules. Les pseudohyphes, en revanche, ressemblent à des ellipsoïdes allongés. Les cellules de forme ellipsoïde restent attachées les unes aux autres au niveau du site de cloisonnement rétréci au fur et à mesure de leur croissance. En conséquence, les pseudohyphes commencent à se développer en un motif de ramification. Le site Web Nature explique que le placement du noyau à mesure que les cellules se développent, ainsi que le degré de séparation cellulaire entre les nouvelles cellules filles, distingue également les hyphes des pseudohyphes.