Micrococcus luteus est une bactérie sphérique d'une longueur comprise entre 0,5 et 3,5 millimètres qui se développe dans des environnements aérobies et forme des colonies jaunes lorsqu'elle est cultivée sur des plaques de gélose. Micrococcus luteus est généralement Gram positif, bien qu'il puisse parfois être Gram-variable selon la souche. Gram positif signifie que les bactéries se colorent en violet lorsqu'elles sont traitées avec la coloration de Gram. Cela est dû à des différences dans la paroi cellulaire par rapport aux bactéries Gram-négatives.
Micrococcus luteus est généralement décrit comme non pathogène, ce qui signifie qu'il ne provoque pas de maladies chez les personnes à moins que leur système immunitaire ne soit déjà compromis. Les colonies de Micrococcus luteus se développent généralement sur la peau des mammifères et se trouvent fréquemment dans ou sur la bouche et les voies respiratoires des humains. Ces bactéries peuvent également se développer dans le sol et l'eau tant qu'il y a suffisamment d'oxygène présent.
Micrococcus luteus est remarquable en raison de la taille de son génome assez petite, en particulier par rapport à d'autres bactéries libres. Son génome ne fait que 2,5 millions de paires de bases. Des génomes plus petits ont tendance à se produire chez les parasites après la perte des gènes des processus métaboliques que le parasite obtient de son hôte. Cependant, comme Micrococcus luteus peut vivre aussi facilement dans le sol que dans des organismes plus gros, ce n'est pas un parasite et a simplement un petit génome.