Le pharynx vient directement après la bouche dans le système digestif du ver de terre, où il agit comme une pompe d'aspiration, aspirant les aliments. Il excrète également du mucus pour faciliter la digestion dans les stades ultérieurs. Après le pharynx viennent l'œsophage, le jabot, le gésier et les intestins.
Au fur et à mesure que la nourriture passe du pharynx à l'œsophage, l'œsophage libère du carbonate de calcium pour débarrasser le ver de terre de l'excès de calcium et contrôler l'acidité de la nourriture. La nourriture pénètre ensuite dans la culture, où elle est stockée pour une utilisation ultérieure. Une fois que le ver de terre est prêt, la nourriture passe au gésier, qui utilise de petites particules minérales ingérées avec la nourriture combinées à de fortes contractions musculaires pour broyer la nourriture. Enfin, les intestins libèrent des produits chimiques pour faciliter la digestion et absorber les nutriments libérés. Les produits chimiques que les intestins libèrent sont des enzymes, chacune capable de digérer les protéines, les glucides ou les graisses.
Un ver de terre a un anus pour libérer des déchets solides ou non digérés, mais il n'est pas utilisé pour de nombreux déchets chimiques et liquides. Au lieu de cela, un ver de terre a de multiples structures analogues aux reins humains dans plusieurs de ses segments. Ceux-ci éliminent les toxines et les déchets métaboliques du sang et libèrent les déchets de plusieurs pores le long des côtés du corps.
