La Corée du Sud abrite une grande variété de mammifères et d'oiseaux indigènes. Certains d'entre eux, comme la sarcelle du Baïkal en voie de disparition, vivent principalement dans le biome local, tandis que d'autres, comme les baleines, ne vivent que visitez les eaux près de la Corée du Sud de façon saisonnière.
Les baleines comptent parmi les visiteurs les plus spectaculaires de Corée du Sud. Les espèces de baleines que l'on peut trouver à quelques kilomètres de la côte sont les baleines à bosse, les cachalots et les baleines grises. À l'intérieur des terres, la Corée du Sud possède des poissons de rivière et de lac, dont certains ne vivent nulle part ailleurs sur Terre. Parmi ceux-ci se trouvent le Biterling Somjiny, la barbotte trapue coréenne, plusieurs espèces de loches et le méné noir.
La Corée du Sud compte quatre espèces indigènes de salamandre, notamment la salamandre coréenne. Cette espèce a la particularité d'être la seule espèce de salamandre sans poumons connue pour être endémique d'Asie. Les adultes respirent directement par la peau, pas avec les poumons comme le fait la salamandre à griffes coréenne.
Le mulot rayé est commun en Asie de l'Est, mais la Corée du Sud a sa propre variante, le mulot rayé de Jeju, que certains naturalistes ont suggéré de classer comme sa propre espèce. La Corée du Sud compte également un certain nombre d'invertébrés indigènes, notamment un katydide (Sphagniana monticola), un papillon (Pyrausta nigrimaculata) et un longicorne (Demonax seoulensis).
