Le mucus gastrique protège les cellules gastro-intestinales des dommages que les sucs gastriques peuvent causer. Les sucs gastriques sont très acides et, sans ce mucus, l'acide peut détruire les cellules et les tissus de l'estomac.
Le mucus dans l'estomac est riche en bicarbonate, un composé alcalin, pour aider à lubrifier et protéger l'estomac. L'acide gastrique provient des cellules pariétales, un type de cellule gastrique, et c'est un acide chlorhydrique, qui est une solution d'eau et de chlorure d'hydrogène. Cela permet à l'environnement dans l'estomac d'être très acide. Un niveau élevé d'acidité est essentiel pour inactiver les bactéries dans les aliments que les gens mangent et pour activer le pepsinogène, un type d'enzyme.