Les dispositifs d'assainissement marin de type III ont le moins d'impact sur l'environnement. La plupart sont des réservoirs de rétention qui retiennent les eaux usées jusqu'à ce qu'elles puissent être pompées dans un système d'égout local dans une marina. Les TMS de type III comprennent également les toilettes à incinération et à compostage, les systèmes de collecte sous vide et les systèmes de recirculation.
Les garde-côtes américains certifient deux autres classes de TMS. Un appareil de type I ne peut être installé que sur des bateaux d'une longueur maximale de 65 pieds et utilise généralement la macération et la désinfection pour le traitement des eaux usées. Son rejet ou son effluent ne peut contenir plus de 1 000 bactéries coliformes fécales par 100 millilitres et ne peut contenir aucun solide flottant visible. Un MSD de type II peut utiliser un traitement et une désinfection biologiques ainsi que les processus de macération et de désinfection utilisés par les dispositifs de type I. Son effluent ne peut contenir plus de 200 bactéries coliformes fécales par 100 millilitres et 150 milligrammes de matières en suspension totales par litre.