L'une des plus grandes menaces pour la toundra est le réchauffement climatique. Comme les combustibles fossiles brûlent ailleurs sur la planète, l'atmosphère se réchauffe partout. Cela provoque la fonte du pergélisol, entraînant l'effondrement des écosystèmes de la toundra. À mesure que le pergélisol fond, il permet à la matière végétale gelée de se décomposer, libérant plus de dioxyde de carbone et accélérant le réchauffement climatique, selon Marietta College.
Le développement du pétrole et du gaz affecte également la toundra. Alors que le pétrole est difficile à extraire de la toundra, les intérêts des entreprises poussent l'idée que le forage dans les régions arctiques a le potentiel de compenser les prix élevés du pétrole. De plus, les déversements de pétrole, comme celui du 24 mars 1989, lors de l'accident du pétrolier Exxon Valdez, affectent la faune dans la toundra. Ce seul crash est responsable de la mort de 100 000 oiseaux, qui se sont retrouvés piégés dans le pétrole. De plus, des poissons, dont du flétan, du hareng et du saumon, sont morts à cause de la catastrophe. Alors que la majorité du pétrole du déversement a été retiré, une partie continue d'avoir un impact sur la toundra, selon Internetgeography.
Alors que les intempéries empêchent la plupart des gens de vivre dans la toundra, les problèmes de pollution liés aux établissements humains sont graves dans leur région. Les méthodes traditionnelles de traitement des eaux usées ne fonctionnent pas dans un environnement froid.
Les polluants atmosphériques créés par l'homme atteignent les zones reculées de la toundra. Les scientifiques ont trouvé des polluants artificiels, y compris le DDT et les PCB, en quantités mesurables dans toute la région, loin de la zone où ils sont produits.