Les archaebactéries sont des organismes unicellulaires que l'on trouve couramment dans des endroits très inhospitaliers avec des fluctuations de température extrêmes ou dans des eaux à niveaux alcalins ou acides élevés. Le terme archaebactéries a été largement abandonné pour l'utilisation d'archaea , car ils sont leur propre classe d'organismes et ne sont pas des bactéries.
Les archaebactéries ont été découvertes dans les années 1970 par le Dr Carl Woese, qui a déterminé qu'elles ne pouvaient pas être classées comme d'autres organismes unicellulaires tels que les eucaryotes ou les eubactéries en raison de leurs différences génétiques et biochimiques. Les archéobactéries ont des membranes cellulaires très résistantes avec des sucres et des acides aminés différents de ceux que l'on trouve généralement dans les membranes cellulaires des bactéries. Les archéobactéries sont capables de résister à des influences extérieures qui seraient fatales aux bactéries, en raison de la structure chimique de leurs parois cellulaires. Ils sont très doués pour survivre dans des zones où d'autres organismes ne peuvent pas, comme à proximité d'évents géothermiques sous-marins, ou dans des eaux à haute salinité qui tueraient ou repousseraient les poissons et autres micro-organismes.
Les archaebactéries connues sous le nom de méthanogènes se trouvent dans le système digestif de plusieurs types de mammifères, d'insectes et de poissons, et produisent du méthane dans le cadre de leur processus de production d'énergie. Les thermophiles sont capables de survivre dans des habitats à températures élevées, tandis que les psychrophiles vivent dans des environnements extrêmement froids. Les halophiles se trouvent dans des environnements à forte teneur en sel. Les archéobactéries se trouvent également dans des environnements plus hospitaliers tels que les marais, le sol et l'eau de mer.
