Les champignons, les bactéries et les virus forment les trois catégories de micro-organismes. Ces micro-organismes, ou microbes, vivent dans toutes les régions du monde et remplissent des fonctions diverses. Certains aident les organismes vivants tandis que d'autres agissent comme des agents pathogènes ; ils se présentent sous des formes unicellulaires ou multicellulaires, mais leurs petites tailles rendent les micro-organismes visibles uniquement pour les humains à travers des lentilles microscopiques.
Malgré le partage du titre de micro-organismes, les organismes des trois sous-groupes varient physiquement et biologiquement. Les champignons comprennent les champignons et les moisissures, ainsi que les organismes unicellulaires plus petits. Le groupe des champignons comprend les plus grands organismes de toutes les classes de microbes. Ils jouent un rôle écologique et biologique important, en aidant à décomposer et à recycler les matières végétales et animales en décomposition dans les forêts et les zones boisées. Certains champignons mettent en danger la santé des organismes vivants, générant des maladies et des affections, notamment la teigne et le pied d'athlète.
Les champignons s'avèrent également utiles, comprenant des cosmétiques et des médicaments. Les bactéries occupent le deuxième plus grand groupe de micro-organismes. Ils ont des tailles corporelles plus petites que celles des champignons et vivent dans des milieux terrestres et aquatiques. Ces organismes, comme les champignons, s'avèrent bénéfiques et nocifs pour les humains, les plantes et les animaux. Les bactéries utiles soutiennent le bon fonctionnement du système immunitaire et digestif, tandis que les bactéries nocives provoquent des maladies telles que la tuberculose, le choléra et les infections respiratoires. Enfin, les virus viennent dans les plus petites tailles corporelles. Contrairement aux bactéries et aux champignons, ils présentent des conceptions cellulaires simples, dépourvues de membranes, de parois cellulaires et de noyaux.