L'expression "allèles multiples" en biologie fait référence à une série avec au moins trois formes alléliques ou alternatives d'un gène particulier, avec seulement deux qui peuvent exister chez un individu diploïde. Il existe deux allèles présents chez un individu : un allèle paternel et un allèle maternel.
Gregor Mendel, le père de la génétique, a proposé que seuls deux allèles existent pour chaque gène, la forme dominante exprimant son phénotype au sein d'un hétérozygote. Cependant, il est possible que plus de deux allèles différents existent au sein d'une population. L'utilisation du terme « allèles multiples » prête parfois à confusion. Cela ne suggère pas qu'un gène spécifique possède trois allèles ou plus. Aucun individu n'a la capacité d'avoir plus de deux allèles, un paternel et un maternel, même si plusieurs allèles font partie de la population.
Un exemple de gène ayant plusieurs allèles est la série C canine. Le gène "C" fait référence à un chien avec la série de couleurs exprimée. "c" est un albinos, au nez et aux yeux pâles. "cb" fait référence à un chien gris et pâle, tandis que "cd" fait référence à un chien blanc aux yeux noirs. "c-ch" serait un chien avec un motif chinchilla. L'allèle C (la série de couleurs exprimée) est dominant pour tous les autres allèles, tandis que "c-ch" est dominant pour tous les autres ("cd", "cb" et "c"). Le gène albinos est récessif à tous les autres.
