Le cycle de l'azote d'un aquarium est le processus qu'un nouvel aquarium subit pour établir des colonies bactériennes, selon About.com. Comme les poissons excrètent les déchets et les plantes à l'intérieur de l'aquarium pourrissent, les bactéries se développent pour convertir ces déchets en sous-produits moins toxiques. Les poissons sont en danger jusqu'à ce qu'il y ait suffisamment de bactéries.
Dans l'état initial du cycle de l'azote, les déchets de poisson sont décomposés en ammoniac, qui peut être toxique s'il est laissé pendant trois jours ou plus. À l'étape suivante, les bactéries oxydent et éliminent l'ammoniac mais produisent du nitrite comme sous-produit, qui est également toxique pour les poissons. Dans l'état final, différentes bactéries transforment les nitrites en nitrates, qui ne sont pas toxiques à faible dose. Changer l'eau régulièrement aide à contrôler les niveaux de nitrate.