Les colonies de levures sont plus grandes que les colonies de bactéries car les cellules de levure individuelles sont considérablement plus grandes que les cellules bactériennes. Les levures et les bactéries sont des micro-organismes unicellulaires, mais les levures sont des eucaryotes et les bactéries sont des procaryotes. Une cellule eucaryote contient un noyau et des organites structurels enfermés dans une double membrane. Les levures ont également des parois cellulaires épaisses qui encapsulent l'organisme. Les procaryotes, tels que les bactéries, sont plus petits car ils n'ont pas de noyau et d'organites liés à la membrane.
Les cellules de levure augmentent en nombre de manière asexuée par bourgeonnement. Comme l'a expliqué Gary Kaiser du Community College of Baltimore County, un bourgeon se forme sur la surface externe d'une cellule mère et le noyau de la cellule se divise. L'un des noyaux divisés pénètre dans le bourgeon en formation et le matériau de la paroi cellulaire est produit entre la cellule mère et le bourgeon. Le bourgeon se détache pour devenir une nouvelle cellule fille. Cette multiplication de cellules de levure génétiquement identiques peuple une colonie. Les bactéries se divisent et peuplent les colonies par fission binaire, une autre forme de reproduction asexuée. L'ADN circulaire de la bactérie se réplique et les copies sont séparées aux extrémités opposées de la cellule. La paroi cellulaire de la bactérie se développe, tout en formant une fente au centre de la cellule. La fente finit par pincer la cellule en division en deux cellules filles distinctes mais identiques. La fission binaire se poursuit dans chaque cellule fille, peuplant la colonie bactérienne.