Selon le dictionnaire Merriam-Webster, « non pathogène » signifie qu'un organisme ne cause pas de maladie, donc les bactéries non pathogènes ne causent pas de maladie. Certaines bactéries sont utiles dans leur environnement.
Par exemple, le tube digestif humain contient des bactéries qui l'aident à fonctionner correctement. Ces bactéries ne facilitent pas seulement le processus digestif, elles tuent également les bactéries pathogènes. Les bactéries sont utilisées dans la production de certains produits laitiers, comme le fromage, la crème sure et le yaourt. Dans le monde naturel, certaines bactéries fonctionnent comme des décomposeurs, décomposant les organismes morts. D'autres types de bactéries consomment du pétrole, et cette tendance naturelle est plus visible lors des déversements ou des fuites de pétrole.
