Le chlorure de béryllium est une molécule non polaire. La forme du BeCl2 est linéaire, le béryllium central étant lié de chaque côté à un atome de chlore. Les électronégativités des atomes de chlore s'annulent donc, laissant une molécule non polaire.
Le chlorure de béryllium est un exemple de molécule déficiente en électrons car l'atome de béryllium ne partage qu'un total de quatre électrons, alors que les atomes de la plupart des molécules covalentes en partagent huit. Normalement, des atomes tels que le béryllium situés dans le premier ou le deuxième groupe du tableau périodique forment des liaisons ioniques, ce qui leur permet d'atteindre une configuration de gaz noble sans partager d'électrons. Cependant, le béryllium est significativement plus électronégatif que la plupart des atomes de ces groupes, c'est pourquoi il forme des liaisons covalentes.
