L'Encyclopaedia Britannica explique que la pepsine est la plus active dans l'estomac. La pepsine n'est plus efficace dans l'intestin, où les acides gastriques sont neutralisés. Le pouvoir digestif de la pepsine est le plus important aux niveaux d'acidité du suc gastrique ordinaire.
La pepsine est une enzyme présente dans le suc gastrique. Il digère les protéines présentes dans les aliments tels que les produits laitiers, les œufs, la viande et les graines. La pepsine est produite dans l'estomac, où l'acide chlorhydrique se combine avec la protéine inactive connue sous le nom de pepsinogène. La pepsine est également active en petites quantités dans la circulation sanguine, où elle décompose des fragments de protéines plus gros ou partiellement non digérés que l'intestin grêle pourrait avoir absorbé.