Le système immunitaire maintient l'homéostasie en empêchant les agents pathogènes de perturber le fonctionnement normal du corps. Il y parvient de diverses manières, y compris l'immunité adaptative lorsque le corps rencontre un nouvel agent pathogène, l'immunité innée, sécrétant des acides sur le peau et en utilisant les muqueuses pour décomposer les bactéries.
Plusieurs facteurs peuvent perturber l'homéostasie, notamment les virus et autres micro-organismes qui provoquent des fièvres, élèvent la tension artérielle et modifient le pH sanguin. Le système immunitaire maintient l'homéostasie en empêchant ces micro-organismes de devenir problématiques et en réduisant leur capacité à perturber le fonctionnement normal. Par exemple, dans l'immunité adaptative, le système immunitaire se souvient d'un agent pathogène lorsqu'il pénètre pour la première fois dans le corps. Lorsqu'il pénètre dans le corps pour la deuxième fois, il s'attaque immédiatement à lui, l'empêchant de provoquer une deuxième infection et de perturber l'homéostasie.
Le système immunitaire protège le corps de plusieurs manières, notamment la peau, les antigènes et les muqueuses. La peau est la première ligne de défense du corps. Le système immunitaire favorise un pH cutané qui dissuade certaines bactéries. Lorsque les antigènes rencontrent une substance étrangère, ils s'en souviennent et produisent plus tard des anticorps lorsqu'ils pénètrent à nouveau dans la circulation sanguine. Les voies respiratoires abritent les muqueuses et les cils. Les muqueuses contiennent des enzymes qui s'attaquent aux agents pathogènes et les cils les balayent.