L'humidité abaisse la pression atmosphérique en déplaçant les molécules d'azote et d'oxygène par des molécules d'eau plus légères. Les différences d'humidité peuvent provoquer la formation d'orages. L'air humide présente également des défis pour les pilotes.
Les molécules d'eau contiennent un atome d'oxygène lourd et deux atomes d'hydrogène légers, elles pèsent donc moins que l'oxygène atmosphérique, qui contient deux atomes d'oxygène lourds, et l'azote atmosphérique, qui contient deux atomes d'azote lourds. Ces molécules d'eau forcent les molécules plus lourdes à se répandre, ce qui réduit la pression de l'air.
Parce qu'elles sont si légères, les molécules d'eau ont tendance à s'élever dans l'atmosphère, c'est pourquoi les nuages se forment généralement haut dans le ciel. Ces différences de pression atmosphérique font que l'air se déplace entre différentes couches, ce qui peut éventuellement provoquer des tempêtes. La plupart des tempêtes se forment au-dessus de l'océan où le soleil brûlant chauffe l'eau et provoque ce type de perturbations.
Étant donné que l'air froid et sec est plus dense que l'air chaud et humide, les ailes d'avion ont plus de molécules à déplacer, ce qui leur permet de générer plus de portance. Par conséquent, les pilotes doivent faire preuve de prudence lorsqu'ils voyagent dans des zones très humides et très chaudes. La pression atmosphérique est encore plus basse à haute altitude, donc une partie du Mexique et d'autres endroits avec ces conditions nécessitent des précautions supplémentaires lorsque les pilotes décollent et atterrissent.