Selon la Reptile Database, la majorité des serpents ont 36 paires de chromosomes. Vingt des chromosomes sont considérés comme des microchromosomes, tandis que les autres sont appelés macrochromosomes. Cependant, le terme "serpents" fait référence à plus de 3 400 espèces différentes et beaucoup n'ont pas fait étudier leur caryotype, donc certaines variations peuvent exister.
Contrairement à de nombreux reptiles, tels que les crocodiles, les tortues et certains geckos, le sexe des serpents est déterminé par leurs chromosomes, plutôt que par les conditions environnementales qui entourent les œufs en développement. Cependant, les serpents présentent le schéma inverse de celui démontré par les humains. Alors que les mâles humains sont du sexe hétérogamétique, comportant un chromosome X et un chromosome Y, les serpents femelles sont du sexe hétérogamétique et comportent un chromosome Z et W.
