La première expérience scientifique qui a indiqué l'existence d'atomes a été réalisée par John Dalton au cours des années 1800. Ces premières expériences n'ont pas fourni d'informations concernant la structure de l'atome. La structure des atomes a été expliquée pour la première fois par la découverte des électrons en 1897 par le physicien J. J. Thompson.
L'idée philosophique d'un atome a été développée par le philosophe grec Démocrite en 460 av. L'idée d'un atome était le résultat d'une question relative aux limites de la division de la matière. Cette idée a ensuite été rejetée par Aristote et n'a donc reçu aucun mérite de la part des philosophes ou des individus grecs.