Les problèmes éthiques liés à l'ADN recombiné répondent aux préoccupations selon lesquelles les organismes et les aliments contenant de l'ADN recombiné sont potentiellement dangereux. La plupart des scientifiques considèrent que la technologie de l'ADN recombinant est sûre, tandis que divers groupes de défense et de santé affirment que les groupes de réglementation sont biaisés et que des recherches supplémentaires sont nécessaires pour évaluer les dangers possibles.
Après les premières publications décrivant l'utilisation réussie de la technologie de l'ADN recombinant en 1972 et 1973, la Conférence Asilomar sur l'ADN recombinant s'est réunie en 1975 pour discuter des directives concernant son utilisation. Il a proposé des recommandations détaillées et un moratoire sur les expérimentations potentiellement dangereuses. Plus tard, les National Institutes of Health ont publié des directives plus formelles. Les réglementations gouvernementales sont basées sur les directives du NIH.
L'Union of Concerned Scientists, l'Organic Consumers Association, le World Wildlife Fund et Greenpeace remettent en question l'éthique de l'utilisation libérale de la technologie de l'ADN recombinant. Les principales objections à son utilisation se concentrent sur ses conséquences à long terme lorsqu'il est utilisé dans la modification des aliments. Les considérations comprennent la possibilité de contamination d'aliments génétiquement non modifiés, l'étiquetage obligatoire pour identifier les produits contenant des organismes génétiquement modifiés, l'efficacité des réglementations gouvernementales, les effets à long terme sur l'environnement et la santé et une surveillance suffisante des entreprises qui traitent de la technologie ou des produits de l'ADN recombinant.
Aux États-Unis, les critiques remettent en question l'objectivité des agences de réglementation trop favorables aux entreprises vendant des produits contenant de l'ADN recombinant. Les critiques s'opposent également à un double standard dans l'Union européenne entre la culture d'aliments destinés à être utilisés dans l'UE et à l'exportation.
