Les avantages d'un endosquelette comprennent de fortes propriétés de port de poids et une croissance uniforme, tandis que les inconvénients incluent une protection et un effet de levier moindres pour les muscles. Les endosquelettes se trouvent généralement chez les animaux plus gros en raison d'un meilleur soutien du poids, car les exosquelettes peuvent limiter la croissance due au poids.
Un endosquelette fait référence à un squelette interne, par opposition à un exosquelette qui fait référence à un squelette externe. Étant interne, un endosquelette peut supporter un poids plus important sans devenir trop lourd pour l'organisme. Un exosquelette finira par devenir trop lourd pour un organisme, limitant ainsi sa taille. De plus, l'endosquelette peut grandir avec l'organisme, contrairement à un exosquelette qui nécessite une mue régulière car il est rigide et ne grandit pas.
Etant interne et recouvert de muscles et de tissus, un endosquelette offre peu de protection à l'organisme. Il existe également des zones moins rigides contre lesquelles les muscles peuvent tirer, ce qui réduit l'effet de levier.