Le canal central, ainsi que l'ensemble du système ventriculaire dont il fait partie, est tapissé d'épendyme, une forme spécialisée d'épithélium contenant des cellules neurologiques. Le canal central ou canal épendymaire s'étend longitudinalement sur toute la longueur de la moelle épinière et contient du liquide céphalo-rachidien.
L'épithélium est un tissu spécialisé qui tapisse l'intérieur des surfaces et des cavités du corps et ne contient pas de vaisseaux sanguins. L'épendyme est composé de cellules d'épendyme, qui produisent du liquide céphalo-rachidien dans le plexus choroïde mais pas dans le canal central. Les cellules d'épendyme sont cylindriques simples ciliées. Les cils qui tapissent les surfaces des cellules épendymaires font circuler le liquide céphalo-rachidien dans le canal central et le système nerveux central. Les microvillosités recouvrent également leurs surfaces et absorbent le liquide céphalo-rachidien.
La libération de fluide à travers l'épendyme est contrôlée par des jonctions serrées et modifiées entre les cellules de l'épendyme. Cette libération de liquide permet l'échange de liquide céphalo-rachidien entre le système ventriculaire et les tissus neurologiques du cerveau et de la moelle épinière. La membrane basale des cellules de l'épendyme a des extensions en forme de tentacules qui se fixent aux astrocytes, une forme de cellule neurologique. Le liquide céphalo-rachidien protège et amortit le cerveau et la moelle épinière et aide à maintenir une bonne circulation sanguine neurologique. Il est composé à 99% d'eau et contient des protéines plasmatiques.
