Les menaces pesant sur les forêts de feuillus comprennent les pluies acides, la coupe à blanc d'arbres et l'introduction d'espèces non indigènes. Ces menaces mettent en péril l'atmosphère et la vie des organismes vivant dans les forêts de feuillus tempérées de plusieurs manières. Bien que provenant de différentes sources, les effets négatifs sur les forêts de feuillus contribuent à un déclin de la santé et même de la taille des forêts au fil du temps, modifiant leur paysage et compensant les équilibres délicats des écosystèmes.
Les pluies acides, une menace d'origine humaine, nuisent aux forêts de feuillus de plusieurs manières. Cette pollution provient des émissions des véhicules et de la pollution des centrales électriques qui brûlent des combustibles fossiles. Les particules toxiques s'accumulent dans l'atmosphère, puis sont rejetées dans la terre sous forme de pluie acide. Cette pluie chimique affecte principalement les arbres et leurs feuilles. Il retarde la croissance des feuilles des arbres, les rendant plus petites et moins efficaces dans la production de baies et de graines. À leur tour, les arbres souffrent d'une capacité de reproduction inférieure. Ils deviennent également plus vulnérables aux maladies et aux dommages causés par les insectes et le gel.
L'introduction d'espèces non indigènes menace également les forêts de feuillus tempérées. Ces espèces prospèrent dans les habitats forestiers et compensent les chaînes écosystémiques naturelles. Ils rivalisent avec les plantes et les animaux indigènes pour la nourriture, les ressources et la terre, tuant parfois complètement les populations indigènes. Enfin, les forêts tempérées subissent des coupes rases ou la suppression de vastes étendues de couvert arboré. Les humains défrichent de vastes zones pour créer des terres agricoles ou récolter du bois, laissant les forêts fragmentées et dégradées.