La fonction principale des poumons d'un rat est de soutenir la respiration. La respiration est accomplie par la respiration dans laquelle l'air pénètre dans le corps par le nez ou la bouche, descend la trachée et dans les bronches des poumons .
Les alvéoles, petites branches des bronches, sont spécifiquement conçues pour effectuer les échanges gazeux au niveau cellulaire. L'oxygène dans les alvéoles pénètre dans la circulation sanguine par diffusion et le dioxyde de carbone pénètre dans les poumons. Ce dioxyde de carbone est expulsé lorsque le rat expire.
Les poumons sont entourés de côtes et du diaphragme musculaire. Le diaphragme se contracte pendant l'inspiration, créant une pression négative et aspirant l'air dans les poumons. Lorsque le diaphragme se détend, l'expiration se produit.