Le pH dans l'intestin grêle augmente de pH 6 dans le duodénum à pH 7,4 à l'extrémité distale de l'intestin grêle dans l'iléon terminal. Le pH diminue à pH 5,7 dans le caecum mais augmente à pH 6,7 dans le rectum.
La partie la plus acide du tractus gastro-intestinal humain est l'estomac, dont le pH est généralement compris entre 1 et 3. L'acidité élevée de l'estomac combat les bactéries ingérées avec les aliments. Au fur et à mesure que la distance de l'estomac augmente, le niveau de pH augmente progressivement. Le gros intestin a un pH de 5,5 à 7.
