Le mécanisme de coloration des champignons par le lactophénol bleu coton est l'utilisation du lactophénol comme agent nettoyant, ce qui signifie qu'il est capable de tuer l'organisme. Ensuite, l'acide lactique préserve la structure du champignon. Le bleu coton est capable de colorer le cytoplasme avec une certaine teinte de bleu clair, ce qui permet aux scientifiques d'observer la lame qui contient les cellules fongiques.
La coloration d'un échantillon d'une cellule consiste à colorer ou à distinguer visuellement certaines parties de la cellule les unes des autres. Cela permet aux scientifiques de différencier les parties de la cellule et de les observer plus clairement. La coloration des organismes eucaryotes peut être vitale pour la compréhension humaine de certains processus et phénomènes biologiques. Comprendre certains types de champignons peut être utile dans le développement d'antibiotiques et d'autres produits et est même utilisé pour la fermentation ou la prévention de maladies dans les industries agricoles.
Lors de l'utilisation de la technique de coloration au bleu de coton lactophénol, un scientifique doit prendre une lame propre et y ajouter une goutte de solution de bleu de coton lactophénol. Ensuite, une aiguille stérilisée peut transférer un tapis sur ce fluide avant qu'il ne soit recouvert d'une autre barbotine. Cela permet au lactophénol de nettoyer et de tuer l'organisme, et l'acide lactique conserve sa forme. La cellule peut ensuite être teinte et observée.