Selon la Colorado State University, l'acide chlorhydrique dans l'estomac tue toutes les bactéries présentes dans les aliments. Il attaque directement les protéines et active l'enzyme pepsine, qui est encore plus puissante pour décomposer les protéines. Springfield Technical Community College note que l'acide est libéré à la fois lors de la détection des aliments et de l'ingestion.
La Colorado State University explique que les sécrétions gastriques, également appelées sucs gastriques, ont quatre composants principaux. L'un est l'acide chlorhydrique, les autres étant du mucus, des enzymes attaquant les protéines appelées protéases et des hormones. Les hormones contrôlent à la fois la libération d'acide et les mouvements de l'estomac. L'estomac libère également quelques autres substances qui aident les intestins à absorber les nutriments plus tard.