Le concept d'espèce morphologique regroupe les espèces selon des similitudes morphologiques et ignore d'autres différences telles que l'ADN ou l'incapacité à se reproduire entre les individus. Le concept d'espèce morphologique découle de la morphologie, qui est l'étude de la physique aspects d'un organisme et leur disposition.
La morphologie est essentiellement l'étude de la structure des parties des organismes. Les morphologues se concentrent sur la compréhension de la disposition des pièces, y compris les caractéristiques physiques externes ainsi que les organes internes, les systèmes et les structures osseuses. Contrairement à la physiologie, qui se concentre sur la fonction des parties d'un organisme, la morphologie ne cherche qu'à comprendre et classer les parties et leur disposition dans divers organismes. Une espèce morphologique est classée en fonction uniquement de la morphologie ou de la structure. Selon le concept d'espèce morphologique, un morphologue utiliserait la taille, la forme, la couleur et la structure d'un organisme et le comparerait à un autre pour déterminer son espèce. S'il est vrai que les variations entre les organismes étroitement apparentés sont moindres que celles parmi les organismes éloignés, le concept d'espèce morphologique ignore certains aspects importants du développement des organismes utilisés pour classer les espèces. Certaines espèces sont structurellement similaires, mais sont des créatures génétiquement distinctes. Ces créatures sont appelées espèces cryptiques. En suivant uniquement le concept d'espèce morphologique, ces créatures seraient classées comme une seule espèce malgré de vastes différences génétiques. Cependant, presque tous les scientifiques utilisent une certaine quantité de morphologie pour classer et distinguer les espèces, car la forme et la structure physiques sont des éléments clés de la compréhension des organismes.