Une analogie pour le réticulum endoplasmique lisse sont les salles d'une usine à travers lesquelles l'information passe. L'information dans le cas d'une cellule est l'ARN messager.
Une cellule est analogue à une usine. Les matières premières entrent dans la cellule ou dans une usine pour produire des marchandises, et les marchandises dépendent du type de cellule. Par exemple, une cellule du pancréas produit de l'insuline, un élément spécifique qui a un usage spécialisé. Pour produire de l'insuline, cette usine absorbe les matières premières que sont l'oxygène et les nutriments.
Les pièces d'une usine ont leurs équivalents dans des cellules. Les membranes cellulaires sont comme des murs, séparant chaque partie de l'usine ou de la cellule. Le noyau de la cellule est le siège ou le bureau principal, où sont situés les contrôles. L'ADN, ou les plans et manuels d'usine conservés en toute sécurité dans le bureau principal, sont les règles qui régissent la façon dont les produits doivent être fabriqués. Ces plans sont copiés et transmis aux travailleurs sous forme d'ARNm.
Alors que le réticulum endoplasmique lisse est le couloir par lequel l'ARN messager se déplace pour déplacer l'information, le réticulum endoplasmique rugueux est la chaîne d'assemblage où les travailleurs ou les ribosomes assemblent les produits, qui sont les protéines. Les matières premières sont conservées dans la salle de stockage, ou cytoplasme, retirées par l'ARNt ou les assistants de stockage, lorsqu'elles sont nécessaires sur la chaîne de montage.
