Peut-être l'analogie la plus claire qui puisse être faite pour décrire le rôle du réticulum endoplasmique rugueux est celui d'une chaîne de montage d'usine. Le long de sa surface, que Dictionary.com décrit comme « rugueuse » en raison de les ribosomes disposés le long de sa membrane, les protéines sont synthétisées et transportées pour être utilisées dans la chimie de la cellule.
Le réticulum endoplasmique rugueux est une longue structure alambiquée à l'intérieur de la cellule qui est repliée en une série de sacs le long de son parcours. Il relie le noyau de la cellule à sa membrane plasmique et est souvent entrelacé avec le réticulum endoplasmique lisse, qui a une fonction légèrement différente et est plié en une forme plus tubulaire que le réticulum endoplasmique rugueux. Les protéines et, dans les leucocytes, les anticorps sont assemblés le long du réticulum endoplasmique rugueux et acheminés à chaque extrémité pour être utilisés dans la biologie cellulaire, selon About.com.
À partir de la description que donne About.com, il est facile d'imaginer les composants de diverses protéines, telles que l'insuline, véhiculés le long de sa surface et assemblés comme s'il s'agissait de voitures dans une usine. Une fois que les protéines ont atteint la fin de leur voyage, elles sont prêtes à être utilisées pour maintenir l'équilibre chimique du corps et sont libérées dans le cytoplasme.