Un écosystème autosuffisant est un écosystème qui n'a pas besoin d'échanger ou d'avoir de contact avec un écosystème extérieur ou adjacent. Ceux-ci sont le plus souvent considérés comme des écosystèmes de bouteilles ou des écosystèmes de bocaux/dômes en verre . Ces écosystèmes de bocaux en verre sont souvent offerts en cadeau.
Les écosystèmes autonomes, même du type bouteille, peuvent être importants pour que les scientifiques étudient et aident à créer des systèmes pouvant être utilisés sur des stations spatiales ou pour aider à soutenir l'écosystème sur Terre. Certains écosystèmes autonomes à grande échelle sont des projets comme Biosphère 2 et les programmes Bios, dont il existe trois versions. Un système autonome doit avoir quelques éléments clés, tels que de l'eau, des plantes pour créer de l'oxygène et de la lumière du soleil.