Les yeux se ferment juste avant un éternuement en raison d'une action réflexe car les yeux et le nez sont reliés par des nerfs crâniens. L'éternuement envoie une stimulation qui se déplace vers un nerf du cerveau et un nerf dans les paupières déclenchant la fermeture des yeux.
Selon LiveScience, les éternuements sont un moyen par lequel le corps protège les voies nasales des particules étrangères. L'air est expulsé de la zone des poumons et le cerveau ordonne aux muscles de se contracter de l'œsophage jusqu'au sphincter. Ces commandes incluent les muscles qui contrôlent les paupières. Certains éternuements peuvent même faire verser des larmes aux yeux.