La majeure partie de la digestion et de l'absorption se produit dans l'intestin grêle. Il s'agit d'un tube étroit mesurant 20 pieds de long, divisé en trois parties comprenant le duodénum, le jéjunum et l'iléon. Les enzymes sécrétées dans l'intestin grêle décomposent le chyme de l'estomac et absorbent les nutriments.
Le chyme de l'estomac pénètre dans le duodénum en forme de C, où la paroi intestinale sécrète la bile, le suc pancréatique et d'autres enzymes. Ces fluides neutralisent les acides gastriques et décomposent les graisses, les huiles, les protéines et les glucides. Les nutriments et les sous-produits vont au jéjunum enroulé pour être absorbés, et tous les produits restants vont à l'iléon pour être excrétés.