L'eau du déshumidificateur n'est pas distillée. Le magazine Stanford affirme que l'eau d'un déshumidificateur contient toujours des contaminants biologiques en plus des résidus métalliques, alors que l'eau distillée n'en contient ni.
Le fonctionnement d'un déshumidificateur n'est pas si différent de la distillation réelle, car les deux ont des résultats finaux d'eau évaporée puis condensée. Cependant, les métaux lourds dans le déshumidificateur sont toujours présents et tout environnement non stérilisé (comme le réservoir) sert d'environnement ouvert aux microbes. L'eau recueillie à partir d'un déshumidificateur est appelée « eau grise ». Ce type d'eau n'est pas recommandé pour la consommation humaine ou animale, mais il est considéré comme sûr pour d'autres usages, tels que l'arrosage des plantes.