En règle générale, les déshumidificateurs doivent être réglés sur un niveau d'humidité relative, ou HR, compris entre 30 et 50 %. Cela indique la quantité de vapeur d'eau réellement présente dans l'air par rapport à la quantité d'air. capable de tenir à une certaine température.
Par temps froid, lorsqu'un système de chauffage est utilisé, le niveau d'humidité relative doit être maintenu entre 30 et 40 %. Sinon, de la condensation peut se former sur les fenêtres. Des niveaux d'humidité relative supérieurs à 50 pour cent sont plus susceptibles de permettre aux bactéries de se développer. Certains déshumidificateurs n'ont pas de composants qui surveillent le niveau d'humidité. Le programme Energy Star recommande l'achat d'un hygromètre, qui lit indépendamment le niveau d'humidité d'une pièce et guide le propriétaire pour allumer ou éteindre le déshumidificateur.