Les nénuphars se reproduisent par graines et par de nouvelles plantes poussant à partir des grandes racines étalées, qui sont des tiges souterraines appelées rhizomes. Les pétales entourent les organes reproducteurs mâles et femelles. Les pétales ne sont ouverts que pendant la journée pendant trois jours.
Le premier matin, les pétales s'ouvrent et les fleurs produisent un fluide au centre en forme de coupe, après quoi elles sont prêtes à recevoir le pollen d'autres fleurs. Les insectes couverts de pollen sont attirés par l'odeur sucrée et tombent dans le liquide lorsqu'ils pénètrent dans la fleur. Le liquide lave le pollen de leur corps et sur les parties femelles de la fleur, appelées stigmates, provoquant la fécondation. Après trois jours, les nénuphars enroulent leur stock pour aller sous l'eau, et les graines mûrissent pendant ce temps. Les graines sont libérées sous l'eau après plusieurs semaines.
