Les pépins de pomme sont dispersés dans la nature via la zoochorie, ou lorsqu'ils sont transportés par des animaux. Les animaux mangent les fruits et emportent les pépins dans leur tube digestif. Lorsque la graine passe dans les selles de l'animal, la graine germe et propage un nouveau pommier.
Les pommiers cultivés se multiplient de manière asexuée par greffage. Les agriculteurs font cela pour garder les variétés de pommes cohérentes dans un verger. Parce que chaque pépin de pomme contient une combinaison unique d'ADN, deux pépins du même arbre ou même d'un même pommier ne produisent pas des arbres identiques. Différentes tailles de porte-greffe utilisées dans une greffe produisent différentes tailles de pommiers, qui produisent tous des fruits à des rythmes différents.
