Pour créer une hypothèse pour la prise d'empreintes digitales, les enquêteurs posent des questions en fonction de ce qu'ils savent sur le sujet spécifique en question et proposent une affirmation qui peut être prouvée par une expérience. Ensuite, en fonction de leur observations préalables, ils élaborent un énoncé à tester. Par exemple, une expérience pour savoir si les empreintes digitales sont héréditaires pourrait indiquer "Si les empreintes digitales sont héréditaires, alors les tests avec un kit d'empreintes digitales montreront que tous les membres d'une famille ont des empreintes digitales similaires."
Une hypothèse peut être soit une déclaration « si, alors » ou une hypothèse nulle, qui déclare qu'il n'y a pas de relation entre deux choses. Lors de la création d'une hypothèse, un scientifique ou un chercheur s'efforce d'utiliser des termes clairs et de s'assurer que l'hypothèse est vérifiable. Une nouvelle hypothèse s'appuie sur la recherche et la littérature existantes.
Un projet d'expo-sciences scolaire sur les empreintes digitales d'ensembles de jumeaux identiques dans le quartier pourrait poser une hypothèse telle que "Si les empreintes digitales sont prélevées sur des jumeaux identiques, les motifs seront identiques". Un projet sur un groupe d'étudiants racialement diversifié pourrait avoir une hypothèse nulle telle que "Les empreintes digitales ne sont pas liées à la race d'une personne". Un médecin légiste menant une étude pour améliorer l'utilisation des preuves dactyloscopiques dans les affaires pénales pourrait présenter une hypothèse telle que « Si les experts en empreintes digitales travaillant sur un cas particulier sont hébergés dans des installations distinctes des autres enquêteurs sur cette affaire, alors les cas de biais seraient réduits ."