Le domaine eucaryote se compose d'une unité. Ce domaine contient tous les organismes dont les cellules sont constituées de structures complexes enfermées dans des endomembranes. Le domaine eucaryote, avec les domaines des bactéries et des archées, forme les trois domaines de la vie.
Le domaine eucaryote est vaste et contient sept royaumes. Ces royaumes comprennent : Animalia, Plantae, Fungi, Chromalveolata, Rhizaria et Excavata. Bien que les organismes de ces règnes partagent des traits et des caractéristiques uniques, tous les eucaryotes ont des cellules complexes enfermées dans des membranes complexes. Les eucaryotes peuvent être unicellulaires ou multicellulaires, et le groupe comprend les plantes, les animaux et les champignons. La plupart des espèces dans ce domaine sont des micro-organismes protestataires, et ils ont des cellules avec des structures et des noyaux distincts.