Un cobaye peut faire caca plus de 150 fois par jour. Tous les déchets ne finiront pas dans la cage car le rongeur mangera les selles molles.
Le cochon d'Inde doit manger le caca pour se développer et maintenir un système digestif fonctionnel, et s'il ne le peut pas, il peut devenir touché ou mal nourri. Si l'animal est gros ou gestant et ne peut pas atteindre son rectum avec sa bouche, des excréments doivent être laissés au fond de la cage pour que l'animal puisse les ingérer. Il existe des tampons qui peuvent être utilisés pour entraîner les cochons d'Inde à la litière et traiter les matières fécales que le rongeur ne mange pas.
