Linnaeus a basé son premier système de classification sur les organes reproducteurs des plantes, selon une histoire de Carl Linnaeus sur le site Web du musée de paléontologie de l'Université de Californie. La classe et l'ordre d'une plante étaient décidés par ses étamines (organes mâles) et ses pistils (organes femelles). Les plantes sans orientation sexuelle évidente ont été regroupées dans la classe Cryptogamia, autrement connue sous le nom de « plantes avec un mariage caché ».
Finalement, Linnaeus a développé un système qui classait hiérarchiquement les choses vivantes et inanimées, selon Education Portal. Son système allait de la catégorie la plus large à la plus spécifique par ordre décroissant. En étudiant la morphologie, l'apparence d'une créature, Linné a classé plus de 11 000 organismes. Alors que la science moderne utilise la phylogénétique (relations évolutives) comme base d'organisation, le travail de Linnaeus est toujours considéré comme le fondement de la taxonomie.
La théorie de l'évolution de Charles Darwin a changé la façon dont les scientifiques catégorisent les créatures vivantes. Alors que les biologistes sont d'accord avec Linnaeus pour placer les porcs, les porcs-épics et les humains dans le genre Mammalia, ils le font pour différentes raisons, selon Understanding Evolution du Musée de paléontologie de l'Université de Californie. Alors que Linné cherchait à regrouper les espèces par apparence, les taxonomistes modernes suivent la théorie de l'évolution selon laquelle les trois espèces avaient toutes quatre pattes et allaitaient leurs petits parce qu'elles descendaient d'un ancêtre commun.
