Les érables du Japon sont sensibles aux maladies telles que l'anthracnose, la flétrissure verticillienne, la tache goudronneuse, la tache foliaire, la brûlure des feuilles et la pourriture des racines. Certaines de ces maladies sont potentiellement mortelles, tandis que d'autres sont généralement inoffensives et simplement cosmétique.
La flétrissure verticillienne est l'une des maladies de l'érable japonaises les plus dangereuses. Elle est causée par un champignon du sol qui est très difficile à éradiquer. Le champignon attaque l'arbre par ses racines, affectant parfois un côté de l'arbre tout en laissant l'autre intact. La flétrissure verticillienne inhibe l'écoulement de l'eau tout en produisant des toxines. Les feuilles aux marges brunes deviennent plus petites que la normale, puis se fanent et tombent. Finalement, l'arbre meurt. Certains arbres se rétablissent lorsque les membres affectés sont élagués. La meilleure façon de prévenir la maladie est de tester le sol pour le champignon avant de planter dans la région.
L'anthracnose se manifeste d'abord sous forme de taches brunes sur les feuilles. Finalement, l'arbre développe des chancres sur ses branches et son tronc. Ce sont des zones mortes qui entourent l'arbre et parfois le tuent. L'anthracnose est également causée par un champignon, mais le ratissage des feuilles endommagées, la fertilisation, l'arrosage et l'application de fongicides sont des mesures efficaces pour aider l'arbre à se rétablir.
La pourriture des racines provoque des feuilles décolorées, des chancres et un retard de croissance et peut éventuellement être mortelle. La tache goudronneuse, la tache foliaire et la brûlure des feuilles sont toutes des maladies qui affectent l'apparence des feuilles mais ne sont pas autrement nocives pour l'arbre. Le raclage des feuilles mortes et la pulvérisation de fongicides aident à lutter contre ces maladies.