L'intolérance raciale et religieuse a conduit à l'esclavage, au massacre et à l'emprisonnement d'Amérindiens, à des comportements antisémites, à des camps d'internement japonais et américano-japonais et à la formation du Hare Krishna. En 2015, gay les hommes et les femmes continuent de lutter pour l'égalité des droits, y compris le droit de se marier.
Aux États-Unis, les émeutes de l'après-guerre civile ont mis en évidence une intolérance raciale généralisée. L'esclavage n'a été aboli qu'en 1833, et même alors, des églises et des écoles afro-américaines ont été incendiées à Memphis et à la Nouvelle-Orléans. Le Klu Klux Klan s'est également formé à cette époque. Bien que le nombre de ses membres ait diminué au début du XXe siècle, il a connu une résurgence dans les années 1920 et est resté fermement opposé à l'octroi de droits égaux aux Afro-Américains aux États-Unis.
Les historiens peuvent faire remonter l'intolérance en Amérique aux colons européens qui ont forcé les Amérindiens à se convertir au christianisme et à abandonner leurs terres. En 1654, Peter Stuyvesant, affirmant que les réfugiés juifs infecteraient la province coloniale de la Nouvelle-Pays-Bas, tenta de les expulser. Près de 300 ans plus tard, Adolf Hitler a tenté quelque chose de similaire dans l'Allemagne nazie.
En 1732, les colons de Géorgie ont interdit le catholicisme. En 1844, une foule de lyncheurs a assassiné le fondateur mormon Joseph Smith dans une prison de l'Illinois. En 1920, un juge du Massachusetts supervisant le procès pour meurtre des anarchistes et athées autoproclamés Nicola Sacco et Bartolomeo Vanzetti a souvent critiqué leurs convictions personnelles, politiques et religieuses, ce qui a conduit à leur condamnation.