Il existe de nombreuses espèces différentes de mouffettes, qui se répartissent en quatre genres distincts ; les espèces du genre conepatus comprennent les mouffettes à nez de cochon, tandis que le genre mephitis contient une mouffette à capuchon et à rayures, le genre mydaus contient deux types de blaireaux puants, également les plus récents membres de la famille des mouffettes, et le genre spilogale a les mouffettes tachetées — oriental, occidental, méridional et pygmée. Ces espèces de mouffettes partagent les couleurs de base du pelage noir et blanc et résident dans le monde entier, bien que la plupart vivent dans l'hémisphère occidental. Cependant, bien qu'appartenant à la même famille, différentes espèces de mouffettes vivent dans divers endroits et présentent des variations de comportement et de caractéristiques physiologiques.
La plupart des mouffettes, domestiques et sauvages, présentent des variations dans les motifs et les couleurs de leur pelage, ce qui permet de distinguer les différentes espèces. Certaines mouffettes ont un pelage presque entièrement noir, tandis que d'autres espèces ont un pelage principalement blanc. Les mouffettes à capuchon, comme les mouffettes d'autres genres, ont plusieurs modèles de pelage distincts. Ils peuvent avoir une ou deux rayures, ou des motifs avec les deux. Les mouffettes tachetées ont de nombreuses rayures, tandis que les mouffettes à nez de cochon n'en ont qu'une. Les blaireaux puants, comme les mouffettes à capuchon, peuvent avoir une ou deux rayures, ou une combinaison des deux.
Bien qu'elles présentent certaines différences, les espèces de mouffettes partagent certains points communs. Ils ont des glandes spéciales qui émettent des odeurs inoffensives mais gênantes, ont des portées entre deux et 12 petits et maintiennent un régime carnivore.
