Les mouffettes sont la proie de nombreuses espèces différentes, notamment les pumas, les civettes, les coyotes, les renards, les lynx, les blaireaux américains et divers oiseaux de proie. Les mouffettes se défendent contre la prédation grâce à une coloration d'avertissement et à la capacité de pulvériser un liquide collant et nauséabond de leurs glandes anales, qui est fortement irritant pour les yeux. Cependant, les oiseaux de proie sont moins intimidés par les défenses d'une mouffette car leur odorat est généralement beaucoup plus faible que celui des mammifères prédateurs.
Les mouffettes sont petites et pas particulièrement rapides. Par conséquent, leur capacité à vaporiser leur musc est l'une de leurs principales défenses. Cependant, certaines espèces de mouffettes sont capables de grimper pour échapper à la prédation. Ils donnent généralement un avertissement avant de pulvériser en levant la queue ou en faisant le poirier. Si la menace persiste, ils penchent l'arrière-train vers l'avant et vaporisent en essayant de viser les yeux de l'attaquant.
Les mouffettes sont elles-mêmes des prédateurs, bien qu'elles consomment certaines plantes. Leurs proies animales les plus courantes comprennent les insectes, les vers, les rongeurs, les lézards, les serpents, les oiseaux et les œufs. Les mouffettes sont plus actives la nuit. Ce sont des fouisseurs naturels et creusent pour des proies et créent également des terriers pour eux-mêmes. Dans les climats plus froids, les mouffettes accumulent des réserves de graisse pendant l'été, de sorte qu'elles peuvent rester dans leurs tanières et dormir pendant la majeure partie de l'hiver. Cependant, il ne s'agit pas d'une véritable hibernation, car ils redeviennent généralement actifs pendant les périodes de chaleur.
