Certains aspects négatifs des régimes pauvres en graisses incluent l'encouragement à la consommation d'aliments nocifs, l'augmentation des triglycérides, l'évitement des aliments sains et l'abaissement du HDL, ou « bon » cholestérol. De plus, les régimes pauvres en graisses peuvent abaisser les niveaux de testostérone et entraîner des maladies cardiaques.
Bien que les fabricants aient les meilleures intentions des gens à l'esprit, il est indéniable que les produits dégraissés n'ont pas aussi bon goût. Pour compenser cela, les producteurs emballent souvent ces aliments « faibles en gras » avec du sucre. Le résultat de ceci est que les aliments étiquetés comme « faibles en gras » peuvent contenir une quantité nocive de sucre. Les régimes faibles en gras favorisent également la consommation de blé entier et d'huile végétale. Le blé entier, qui contient du gluten, provoque une réaction indésirable chez certaines personnes, tandis que les huiles végétales sont associées à l'inflammation et aux maladies cardiaques à long terme.
Des taux élevés de triglycérides peuvent également entraîner des maladies cardiaques. Les régimes faibles en gras, qui sont généralement riches en glucides, augmentent souvent le taux de triglycérides d'un individu. Comme les régimes pauvres en graisses peuvent contenir des aliments nocifs, ils peuvent également favoriser l'évitement des aliments sains, comme les œufs, la viande et les produits laitiers, qui sont tous d'excellentes sources de vitamines et de minéraux nécessaires. En termes de HDL, ou « bon » cholestérol, la consommation de graisses peut en fait augmenter ces niveaux, alors que des études ont montré qu'un régime pauvre en graisses les réduit.