Certains exemples de protéines simples sont les histones, les globulines, les glutélines, les albuminoïdes et les albumines. Lorsque ces protéines sont décomposées chimiquement avec de l'eau via le processus d'hydrolyse, elles se décomposent généralement en acides aminés uniquement. Parfois, ils contiennent également de petits composés glucidiques.
Les histones sont les protéines qui aident l'ADN à se condenser afin qu'il puisse s'adapter à l'intérieur du noyau sous forme de chromosomes. Certaines histones servent de structures en forme de bobine autour desquelles l'ADN s'enroule. Ces protéines ont une charge positive, ce qui leur permet d'être attirées par l'ADN chargé négativement.
Les globulines sont des protéines simples constituées d'anticorps appelés gammaglobulines, d'enzymes et de protéines de transport. Les faibles niveaux de globuline sur les tests sanguins sont associés à des conditions telles que la néphrose, le dysfonctionnement hépatique et l'anémie hémolytique aiguë. Inversement, des niveaux élevés de globuline peuvent signaler un large éventail de conditions, dont certaines incluent des infections parasitaires, la polyarthrite rhumatoïde, un dysfonctionnement rénal, la leucémie et certaines infections bactériennes et virales.
Contrairement aux protéines simples, les protéines conjuguées contiennent à la fois des acides aminés et des composants non protéiques. Les nucléoprotéines, les phosphoprotéines, les lécithoprotéines et les glycoprotéines sont quelques exemples de protéines conjuguées. Pendant ce temps, une protéine dérivée est formée par l'altération physique ou chimique d'une protéine simple ou conjuguée. Les peptides et les protéines dénaturées entrent dans cette catégorie de protéines dérivées.
