Les règles d'appariement des bases de l'ADN sont régies par les paires de bases complémentaires : adénine (A) avec thymine (T) dans un appariement AT et cytosine (C) avec guanine (G) dans un appariement CG. À l'inverse, la thymine ne se lie qu'à l'adénine dans un appariement TA et la guanine ne se lie qu'à la cytosine dans un appariement GC.
L'acide désoxyribonucléique, ou ADN, contient l'ensemble des informations essentielles à la survie d'un organisme. Cet ensemble d'instructions est codé dans une structure à double hélice composée de monomères nucléotidiques. Chaque nucléotide porte un groupe phosphate, un sucre à cinq carbones appelé désoxyribose et l'une des quatre nucléobases. Les quatre bases contenant de l'azote trouvées dans l'ADN sont A, T, C et G. A et G sont classés comme « purines », tandis que C et T sont considérés comme « pyrimidines ». Les purines sont plus grosses que les pyrimidines.
Une découverte importante concernant la structure de l'ADN a été faite par Edwin Chargaff en 1949. Dans l'une de ses expériences, Chargaff a illustré que la quantité de A est égale à celle de T, tandis que la quantité de C est égale à celle de G Il a ensuite conclu que la base complémentaire de A doit être T et la base complémentaire de C doit être G. Les découvertes de Chargaff ont formé la base du principe d'appariement des bases de l'ADN.