La géométrie moléculaire de IF5, également connue sous le nom de pentafluorure d'iode, est une pyramide à base carrée entourant un atome d'iode central. Chacun des coins de la pyramide est un atome de fluor.
L'angle entre chacune des liaisons de la molécule est de 90 degrés pour les quatre atomes de fluor constituant la base de la pyramide et de 180 degrés pour le seul atome de fluor constituant la pointe de la pyramide. La structure bidimensionnelle du pentafluorure d'iode est écrite sous la forme d'un atome d'iode central entouré de cinq atomes de fluorure en forme d'étoile ressemblant à un astérisque, mais c'est par commodité et ne correspond pas à la vraie forme de la molécule ou aux angles de liaison impliqués .
Le pentafluorure de brome a une forme très similaire au pentafluorure d'iode.